以木材为基质生长的真菌被称为木腐真菌，它们可以出现在倒腐木、树桩、树根或者枯枝上，有的甚至能在含有丰富木质素的其他物质上生长，比如生长在松果上的耳匙菌。又因为它们的菌丝体分解利用木材中的木质素或者纤维素和半纤维素，导致木材出现褐色或者白色腐朽，我们又可以将它们分成白腐菌和褐腐菌。褐腐菌分解木材中的纤维素，剩下大部分未被降解的木质素，形成褐色残留物组成的网状结构即褐腐；白腐菌在腐烂木质过程中同时破坏多糖和木质素，在一定条件下将木质的主要组分木质素、纤维素和半纤维素全部降解为二氧化碳和水。白腐菌不仅可以降解木质素，而且对多种生物难降解的物质，如单苯类化合物、氯苯、苯胺、氨酚、联苯、硝基芳烃化合物、杂环化合物、氰化物、杀虫剂、除草剂、卤化物、塑料及聚合物、挥发性有机物、煤、多环芳烃、染料等也具有很强的生物降解能力，是地球生物化学循环的重要组成部分，在环境保护和饲料转化等方面具有重要作用。
在中国，目前已知的木腐菌有1000多种，大部分的非褶菌目、部分伞菌目等都是属于木腐菌类，木腐菌是最容易驯化成功的类别，人工栽培木腐菌类食用菌占全球食用菌消费总量的85%以上。比如大家熟悉的灵芝、香菇、猴头菇、木耳、茯苓等都已经驯化成功进行人工栽培。
